环状DNA测序工具面世
据物理学家组织网5月14日报道,加拿大阿尔伯塔大学生物学家发明了一种新工具,可对环状DNA进行测序,这将为科学家提供更丰富、更准确的数据,有望促进针对病毒、农业甚至癌症的研究。
这一工具名为“CIDER-Seq”,它使用了被称为“PacBio”的DNA测序技术,研究人员目前已将其发表在网络上,供其他科学家分析DNA序列。
研究主要作者、博士后研究员德文·梅塔说:“借助CIDER-Seq,我们可以了解神秘的环状DNA在人和植物细胞中的功能。”
研究人员解释称,环状DNA在细菌和病毒的基因组中很常见,最近,科学家又在人和植物细胞的核内发现了环状DNA,并将其称为染色体外环状DNA(eccDNA)。这种鲜为人知的环状DNA也常出现在癌细胞中,甚至可能与其快速繁殖的能力有关。
研究人员此前已开始着手调查eccDNA在癌症中的作用,但由于缺乏有效的研究和测序方法,此类研究进展缓慢。
梅塔说:“鉴于此,我们设计了一种新的分子生物学方法和新的生物信息学算法,以最终获得eccDNA的完整序列。我们的方法能对这些分子进行完整测序,并为我们和其他研究人员提供一种新工具,可以更好地了解它们在细胞中的实际作用。”
梅塔指出,新工具可能对农业科学家特别有用,因为许多农作物感染的病毒都拥有环状DNA。他举例说:“在肯尼亚的一次田间试验中,我们使用CIDER-Seq的早期版本,帮助研究了经过基因工程改造的农作物在对抗环状DNA病毒方面的有效性。”
版权声明:凡注明“来源:中国西藏网”或“中国西藏网文”的所有作品,版权归高原(北京)文化传播有限公司。任何媒体转载、摘编、引用,须注明来源中国西藏网和署著作者名,否则将追究相关法律责任。
-
新冠肺炎疫苗如遇产能瓶颈 这些植物可成为“代工厂”吗
研制植物疫苗,就是利用基因工程技术,把病原微生物的抗原基因导入植物基因组中,使抗原蛋白能在植物的可食用部分稳定地长出来,从而培育出可吃的口服疫苗。[详细] -
枯叶蛾科昆虫马尾松毛虫基因组首次解析
11日,从中国林科院获悉,该院专家成功构建出包含30条染色体的马尾松毛虫高质量基因组,日前该成果在《分子生态资源》杂志在线发表。[详细] -
“海稻86”为何不怕咸? 测序技术锁定水稻关键耐盐基因
土壤中盐的胁迫严重影响水稻的生长发育,并降低其产量。如何利用数量性状基因座和连锁标记开发耐盐和高产水稻,是分子育种的关键选项。[详细]

中国西藏网微博
中国西藏网微信






