家鸡的饲养范围最广、数量最大，其数量甚至超过了其他家养动物的总和，并在国民经济和人类社会中发挥了重要的作用。然而，家鸡在何时何地起源这一基本问题，一直没有确切的定论。为系统解析这一问题，研究人员通过解析多年获得的863个基因组，终于搞清家鸡源自哪里、哪个亚种，还澄清了以前的一些错误认识。研究成果在线发表于《细胞研究》杂志上。

　　“弄清家养动物的起源与驯化相关问题，对家养动物的保护和利用，以及了解人类自身的进化历史和疾病发生都具有重要意义。”中科院昆明动物研究所王明山博士说，虽然此前人们已经确定红原鸡是家鸡的主要祖先，但红原鸡分为5个亚种，家鸡究竟起源于哪个红原鸡亚种并不清楚。此前的研究认为，南亚、东南亚和中国北方都可能是家鸡的起源地。

　　为系统性地解析家鸡的起源和驯化，中科院昆明动物研究所张亚平课题组、吴东东课题组联合中国农业科学院等国内外研究人员，获得了全部5个红原鸡亚种的基因组数据，以及分布于东南亚、南亚、中东、东亚、欧洲等地区家鸡的全基因组数据。通过大量的群体遗传学分析，他们发现家鸡并不是此前认为的多地独立起源，印度和中国北方也并非家鸡的起源地。

　　解析所有基因组数据后，研究人员发现，在9500年到3300年前之间，家鸡正式从滇南亚种原鸡中分化出来。目前这个亚种主要分布在中国西南、泰国北部、缅甸等地区，说明该地区很可能是家鸡的驯化中心。驯化之后，随着人类的迁徙和贸易活动，家鸡首先被携带到东南亚和南亚，进而与在那里分布的红原鸡其他亚种以及原鸡的另外3个种发生了不同程度的杂交，这种基因交流推动了家鸡对新环境的快速遗传适应，并丰富了其独特的行为、形态和繁殖性状。